MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 1

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008498	CTC	2	6	10	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008498	TAT	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008498	CAA	2	6	98	103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008498	TTA	2	6	218	223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008498	TTA	2	6	1308	1313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008498	TTAA	2	8	1346	1353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008498	TTA	2	6	1376	1381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008498	AAT	2	6	1394	1399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008498	TAATG	2	10	1412	1421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008498	CTA	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008498	TA	3	6	1442	1447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008498	GTCC	2	8	1557	1564	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008498	A	6	6	1565	1570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008498	CA	3	6	1587	1592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008498	TCT	2	6	2487	2492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008498	CAT	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008498	GCC	2	6	2585	2590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008498	TCG	2	6	2631	2636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008498	TCA	2	6	2665	2670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008498	CAC	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008498	TGA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008498	TGATAA	2	12	2863	2874	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008498	T	6	6	2960	2965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008498	T	6	6	2972	2977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008498	T	6	6	2984	2989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008498	TCA	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008498	TTAAA	2	10	3399	3408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008498	ATA	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008498	TAA	2	6	5118	5123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008498	GAA	2	6	5134	5139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008498	AAT	2	6	5822	5827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008498	GTAA	2	8	5838	5845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008498	T	6	6	5903	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008498	CTG	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008498	ATG	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008498	T	6	6	6020	6025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008498	A	7	7	6053	6059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008498	GCT	2	6	6167	6172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008498	CAA	2	6	6174	6179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008498	TTGC	2	8	6206	6213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008498	GGA	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008498	GAAC	2	8	6321	6328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008498	A	7	7	6332	6338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008498	CGA	2	6	6353	6358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008498	CAAA	2	8	6381	6388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008498	GTGA	2	8	6400	6407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008498	AAG	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008498	GC	3	6	6490	6495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008498	TGC	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008498	CAT	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008498	GGT	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008498	GCA	2	6	6645	6650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008498	ACC	2	6	7846	7851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008498	ATT	2	6	7883	7888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008498	TTG	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008498	T	6	6	7928	7933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008498	TAA	2	6	8047	8052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008498	TTA	2	6	8086	8091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008498	AATC	2	8	8123	8130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008498	AGC	2	6	8150	8155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008498	AG	3	6	9345	9350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008498	GGC	2	6	9426	9431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008498	TCA	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008498	TCTT	2	8	9456	9463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008498	T	6	6	9482	9487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008498	CAA	2	6	9496	9501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008498	GCTA	2	8	9530	9537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008498	AATTT	2	10	9550	9559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008498	TAA	2	6	9698	9703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008498	TGG	2	6	9724	9729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008498	TTA	2	6	9747	9752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008498	T	6	6	9758	9763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008498	GTT	2	6	9769	9774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008498	A	6	6	9872	9877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008498	ATT	2	6	9956	9961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008498	GGT	2	6	9964	9969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008498	ATTT	2	8	10583	10590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008498	ATTA	2	8	10596	10603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008498	ATT	2	6	10620	10625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008498	TTCC	2	8	10652	10659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008498	GA	3	6	10664	10669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008498	CT	3	6	10688	10693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008498	TTC	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008498	A	6	6	10817	10822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008498	TAAA	2	8	10851	10858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008498	A	6	6	10866	10871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008498	TAGC	2	8	10912	10919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008498	TCT	2	6	10936	10941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008498	A	6	6	11061	11066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008498	AGG	2	6	11184	11189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008498	ACC	2	6	11966	11971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008498	TTGC	2	8	12044	12051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008498	ATT	2	6	12075	12080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008498	AGG	2	6	12089	12094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008498	AT	3	6	12718	12723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008498	TTAT	2	8	12805	12812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008498	ATA	2	6	12814	12819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008498	TTC	2	6	12977	12982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008498	GGT	2	6	13003	13008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008498	T	6	6	13060	13065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008498	TTC	2	6	13068	13073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008498	TGAC	2	8	13077	13084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008498	CTT	2	6	13093	13098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008498	T	7	7	13104	13110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008498	TGA	2	6	13125	13130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008498	TCA	2	6	13199	13204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008498	TCA	2	6	13239	13244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008498	T	7	7	13279	13285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008498	AAT	2	6	13324	13329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008498	TAA	2	6	13398	13403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.